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Guia completo: integrar o seufisio com o Moloni

Passo a passo para configurar a AT, o Moloni e o seufisio, e passar a emitir faturação certificada sem sair do sistema.

Atualizado: 27/07/2026
9 min de leitura

Este guia aplica-se apenas a clínicas e estúdios em Portugal e Espanha. Em Portugal, a comunicação com a Autoridade Tributária (AT) exige software certificado — usamos o Moloni como parceiro.

O seufisio não emite faturação diretamente para a AT. Essa comunicação é feita pelo Moloni, que possui a licença certificada. Depois de ligados, faturas, séries e comunicações à AT ficam automáticas a partir do seufisio.

  • Configuração no portal das Finanças (AT)
  • Inscrição e configuração do Moloni
  • Configuração do seufisio
  • Emissão de faturação

1. Configurar a AT (Portal das Finanças)

Aceda ao Portal das Finanças com o NIF do qual serão emitidas as faturas e crie um utilizador dedicado à comunicação por webservice.

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    Entrar na gestão de utilizadores

    Abra portaldasfinancas.gov.pt › Autenticação de contribuintes › Gestão de utilizadores › Criar novo utilizador.

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    Preencher os dados

    O campo Utilizador fica com o seu NIF. No Nome pode colocar “seufisio”.

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    Definir palavra-passe

    Escolha uma palavra-passe forte — vai ser usada nos passos seguintes no Moloni.

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    Ativar as permissões

    Ative WDT (documentos de transporte), WFA (dados da fatura) e WSE (gestão de séries).

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    Submeter

    Clique em Submeter. O novo utilizador fica com o formato NIF/1 (ou o número seguinte se já tinha outros).

2. Criar e configurar a conta Moloni

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    Registar em moloni.pt

    Aceda a moloni.pt e clique em Experimente. Preencha os dados da clínica e confirme o email recebido.

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    Selecionar a empresa

    Após login, selecione a empresa registada.

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    Tipo de negócio

    Escolha “Saúde e Bem-estar” e preencha a morada da clínica.

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    Comunicação à AT

    Coloque o ID do utilizador criado nas Finanças, a palavra-passe, ative o Registo de séries AT, use a série genérica M e ative documentos de transporte e faturação. Guarde e finalize.

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    Ativar a API

    Menu › Configurações › Configuração da API e Plugins. Ative a API, crie um Developer ID (sugerimos o NIF) e clique em Atualizar.

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    Copiar o client secret

    O Moloni gera um client secret. Copie o código — vai ser usado no seufisio no próximo passo.

Guarde o client secret num gestor de palavras-passe. Se o perder, terá de gerar um novo e reconfigurar o seufisio.

3. Ligar o seufisio ao Moloni

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    Abrir as definições

    No seufisio, vá a Configurações › Moloni.

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    Habilitar Moloni

    Carregue em Habilitar Moloni.

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    Colar as credenciais

    Preencha o Developer ID, cole o client secret e informe o email registado no Moloni. Confirme com a palavra-passe do Moloni no aviso que surge.

4. Faturar diretamente do seufisio

Antes de emitir uma fatura é preciso quitar a conta — a emissão não é automática porque pode dar baixa sem faturar.

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    Sincronizar planos

    Em Cadastros Gerais › Gestão da Tabela de Preços pode enviar todos os planos ao Moloni de uma vez com “Cadastrar todos os planos no Moloni”, ou individualmente por serviço.

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    Quitar a conta

    Pode quitar a partir da marcação na agenda › Cobranças › Ações › Quitar, ou na ficha do cliente em Financeiro (fatura a fatura ou em lote).

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    Emitir com NIF

    Financeiro › Nova Faturação › aba Clientes. Escolha o cliente, a(s) conta(s) quitada(s), plano, série e valor. Emita e escolha visualizar ou enviar por email.

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    Emitir como consumidor final

    Na aba Consumidor Final, preencha os campos e emita — não precisa selecionar cliente.

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    Consultar faturações

    Financeiro › Faturações › Ações › Visualizar Faturação para rever ou reenviar.

A opção de envio por email só aparece se o cliente tiver email registado na ficha do seufisio.

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